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高光譜成像技術(shù)在根系表型分析中的應用
發(fā)布時間： 2018-11-27 點擊次數(shù)： 3011次根系是植物的重要組成部分，植物吸收土壤中的水分與養(yǎng)分全依賴根系，所以根系的研究對于植物各學科來說都至關(guān)重要，但是根系分布在地面以下，而且是動態(tài)生長的，這就給根系的監(jiān)測帶來了很多困難。《Nature》雜志于2004年6月出版了一本專輯認為“人類對自己腳下土壤的了解遠遠不及對宇宙的了解”，更是佐證了地下生態(tài)學的研究難度之大。所以，根系研究方法的選擇，相對于對地上部分而言對研究結(jié)果具有更大的影響。
傳統(tǒng)的根窗或微根窗彩色成像技術(shù)是利用顏色識別根系，前提是根系和土壤之間要有比較明顯的反差，但實際根系生長在土壤中，顏色差異并不明顯，這樣根系識別可能會造成比較大的誤差，RGB成像技術(shù)使用就會受限。高光譜成像技術(shù)基于光譜特征在根系識別上具備明顯優(yōu)勢，并且光譜特征對于根系生化特性的識別例如細根發(fā)生、成熟、衰老、死亡的周轉(zhuǎn)過程，根際分泌物成分的變化等，都顯示了高光譜成像技術(shù)在根系研究領域的巨大潛力。
奧地利自然資源與生命科學大學（University of Natural Resources and Life Sciences）作物科學系的Gernot Bodner等利用Specim高光譜成像技術(shù)，以硬粒小麥(Triticum durum)為研究對象，以5nm的光譜分辨率（900nm-1700 nm之間256個光譜帶），定期通過根窗進行高光譜成像分析，空間分辨率達0.1 mm。原始光譜圖像經(jīng)過算法處理后得到目標根系圖像，隨后進行閾值分割、模糊聚類等模型分析，得到根系的形態(tài)學數(shù)據(jù)、根系生長衰老動態(tài)乃至根系生化數(shù)據(jù)。
1649-1447 nm光譜反射率和根系衰變過程的關(guān)系（右圖柱狀標尺顯示為天數(shù)）
北京易科泰生態(tài)技術(shù)公司提供根系觀測研究技術(shù)全面解決方案：
- MiniRhizotron微根窗技術(shù)根系觀測系統(tǒng)方案，包括根系與土壤水分同步監(jiān)測技術(shù)方案
- Rhizotron根窗技術(shù)原位（in-situ）根系表型成像分析技術(shù)方案，包括RGB掃描成像分析技術(shù)、Specim高光譜成像分析技術(shù)、根系生長環(huán)境監(jiān)測技術(shù)（土壤水、溫度、光源、O2等環(huán)境因子監(jiān)控）
- PlantScreen全自動高通量根系表型成像分析系統(tǒng)（RGB成像技術(shù)）
- Specim高光譜根系掃描成像分析系統(tǒng)（ex-situ技術(shù)，洗根后掃描成像分析）
- SisuCHEMA高光譜成像分析系統(tǒng)
- ScieTrace LIBS根系元素分布分析系統(tǒng)
左圖為不同直徑細根高光譜成像反射光譜；右圖為不同濃度Cu2+溶液處理蠶豆幼苗根橫切面LIBS元素分布分析結(jié)果（a,b,c,d），e）為樣品區(qū)特征譜線，f）Cu2+濃度降低其對應譜線強度也依次降低
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